清研智庫：11天12篇國際論文，我們對新冠病毒傳播知道了什么？
作者： 曹蘭天 清研智庫研究員 ?劉沂銘 清研智庫研究員
面對突如其來的新型冠狀病毒肺炎疫情，全球科研團隊通過調研、實驗、數據分析等方法，對疫情進行了研究，并在預印本、期刊等平臺上發布了一系列相關研究論文，我們總結和梳理了有關新冠病毒的國際學術研究。
截止到2月4日，根據條件“主題 = Novel Coronavirus or 2019-nCoV”在Web of Science數據庫進行搜索，獲得文獻48篇，經人工判斷與新冠病毒相關30篇。同時，根據條件“term = 2019-nCov”在預發布平臺BioRxiv上進行搜索，獲得相關論文33篇。
針對新冠病毒肺炎的研究主要集中在病毒傳播與預測模型、病毒特征分析與藥物研究、新聞信息綜述等方面，期刊論文與預發布平臺論文相比，前者更傾向于新聞信息綜述，后者則更多的是病毒傳播與模型預測、藥品研發等等。期刊論文中，研究主題分布為病毒特征6篇、藥物研制3篇、信息搜集13篇、模型預測1篇、傳播7篇，其中，中國發表了12篇、國外18篇；預發布平臺論文中，研究主題分布為病毒傳播與預測模型研究12篇、病毒特征分析與藥物研究21篇，，其中，中國發表了19篇、國外14篇。本研究主要總結的主題是病毒傳播，對于描述病毒特征的論文未做盤點。
代表性主要研究成果梳理如下：
- Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin
作者：中科院武漢病毒所石正麗研究團隊
發表時間：2020.01.22
主要內容：武漢新型冠狀病毒2019-nCoV與一種蝙蝠中的冠狀病毒的序列一致性高達96%，推測2019-nCoV或來源于蝙蝠。
- A mathematical model for simulating the transmission of Wuhan novel Coronavir
作者：廈門大學公共衛生學院陳田木團隊
發表時間：2020.01.19
主要內容：研究人員建立了一個Bats-Hosts-Reservoir-People傳播數學模型，以模擬從感染源(可能是蝙蝠)到人類感染的潛在傳播，根據模型計算基本復制數，以評估2019-nCoV的傳導性。
- Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019-nCoV
作者：瑞士伯爾尼大學社會與預防醫學研究所Julien Riou等人
發表時間：2020.01.23
主要內容：研究人員對疫情早期暴發軌跡進行隨機模擬，發現新冠病毒存在持續的人傳人的潛力，且傳播特征與嚴重急性呼吸道綜合征相關的冠狀病毒(SARS-CoV)和1918年大流行性流感具有類似程度，這些發現強調了加強篩查、監測和控制工作的重要性。
- 2019-20 Wuhan coronavirus outbreak: Intense surveillance is vital for preventing sustained transmission in new locations
作者：牛津大學數學研究所R.N.?Thompson
發表時間：2020.01.24
主要內容：利用47名受感染患者從癥狀出現到住院治療的時間數據，估計輸入病例之后出現持續人際傳播的概率，評估冠狀病毒到達其他國家時持續傳播的風險，強調世界各國當前監測工作的重要性。
- Transmission dynamics of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)
作者：廣東省疾病預防控制中心學術團隊
發表時間：2020.01.25
主要內容：收集2020年1月23日前2019-nCoV確診病例的病歷、流行病學調查或官網資料，利用指數增長(EG)和最大似然估計(ML)估計2019-nCoV和SARS的繁殖數?，結論是2019-nCoV可能比2003年爆發的SARS具有更高的大流行風險，需要更嚴格的控制和預防戰略和措施，以遏制其進一步蔓延。
- The digestive system is a potential route of 2019-nCov infection: a bioinformatics analysis based on single-cell transcriptomes
作者：第二軍醫大學長征醫院學術團隊
發表時間：2020.01.30
主要內容：研究人員分析了4個含有單細胞轉錄組的數據集，發現消化系統和呼吸系統也是2019-nCov感染的潛在途徑。
- Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of?Novel?Coronavirus-Infected Pneumonia
作者：中國疾病預防控制中心Li, Qun等
發表時間：2020.01.29
出版物：《The New England Journal of Medicine》
主要內容：研究人員收集2020年1月22日之前報告的NCIP實驗室確診病例的人口統計學特征、接觸史和疾病時間表，描述病例特點并估計關鍵的流行病學時延分布。
- Importation and Human-to-Human Transmission of a?Novel?Coronavirus?in Vietnam
作者：胡志明市巴斯德研究所Phan, Lan T等
發表時間：2020.01.28
出版物：《The New England Journal of Medicine》
主要內容：研究新冠病毒在越南的輸入和人際傳播
- The Extent of Transmission of?Novel?Coronavirus?in Wuhan, China, 2020
作者：北海道大學醫學院Nishiura, Hiroshi等
發表時間：2020.01.24
出版物：《Journal of Clinical Medicine》
主要內容：根據2020年1月24日前13起出口事件的報告，作者分析并預估中國新冠肺炎的累計發病率和最可信的感染數字單位。
- A familial cluster of pneumonia associated with the 2019?novel?coronavirus?indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster
作者：香港大學醫學院微生物學系Chan, Jasper Fuk-Woo等
發表時間：2020.01.24
出版物：《Lancet》
主要內容：對家庭聚集發病案例的患者的基因序列進行系統發育分析。
- Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified?coronavirus?may boost cross-species transmission from snake to human
作者：四川農業大學Chen, Rui等
發表時間：2020.01.22
出版物：《Virus Research》
主要內容：研究新冠病毒的跨物種傳播，根據新鑒定的2019-nCoV冠狀病毒的現有序列，結合不同動物物種之間的相對同義密碼子使用(RSCU)偏差，進行全面的序列分析和比較。研究結果表明，與其他動物相比，蛇是2019-nCoV最有可能的野生動物宿主，穗糖蛋白內的同源重組可能有助于從蛇到人類的跨物種傳播。
- Potential of large ‘first generation’ human-to-human transmission of?2019-nCoV
作者：武漢生物工程大學病毒載體工程研究中心Li, Xingguang等
發表時間：2020.01.30
出版物：《Journal of Medical Virology》
主要內容：對病毒基因組序列進行了系統發育和似然映射分析，研究結果表明： 2019-nCoV的星型信號和拓撲結構可能預示著潛在的大規模“第一代”人際病毒傳播。